基因數據分析軟件遷移-rMATS-4.1.0

前提條件，推薦安裝gcc5.4.0環境，必須R語言環境

安裝依賴

yum install -y python-devel gsl-devel blas blas-devel lapack lapack-devel git

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple cython --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple numpy --trusted-host pypi.tuna.tsinghua.edu.cn

下載軟件包

Wget https://github.com/Xinglab/rmats-turbo/releases/download/v4.1.0/rmats_turbo_v4_1_0.tar.gz

解壓軟件包

tar -xf rmats_turbo_v4_1_0.tar.g

修改rmats-turbo-4.1.0/rMATS_C/Makefile如下：

執行編譯安裝

./build_rmats

基因測序

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