基因數據分析軟件遷移-scvelo

安裝依賴

yum install hdf5 hdf5-devel blosc blosc-devel -y

pip install cython -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

安裝lzo2,下載源碼到本地目錄

wget https://github.com/damageboy/lzo2/archive/refs/heads/master.zip

解壓軟件包

unzip master.zip

進入解壓目錄

cd lzo2-master

執行編譯安裝

./configure --enable-shared=yes && make -j 16 && make install

安裝scvelo

pip install scvelo -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

備注：

此報錯表示hdf5依賴未安裝

此報錯表示需要安裝numpy和pyparsing，并且需要安裝對應版本

基因測序

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