鯤鵬云服務器源碼安裝randfold

randfold是一個獨立的基因測序相關軟件，它從原始序列開始隨機顯示其核苷酸順序。它根據改組后的序列計算推斷結構的最小自由能（MFE），并多次重復計算以建立最小自由能（MFE）值的分布。

云服務器要求

本文以云服務器KC1實例測試，云服務器配置如表 云服務器配置所示。

項目

說明

規格

kc1.large.2 | 4vCPUs | 8GB

磁盤

系統盤：高IO（40GB）

操作系統要求

操作系統要求如表 操作系統要求所示。

項目

說明

-

CentOS

7.6

在公共鏡像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共鏡像中已提供。

安裝相關依賴。

yum install -y git

獲取“randfold”源碼包。

cd /usr/local/

git clone https://github.com/eb00/randfold.git

編譯randfold

cd randfold/src/squid-1.9g

./configure && make

編譯randfold。

cd ../

make

編譯完成后會生成可執行文件“randfold”。

設置軟連接。

ln -s /usr/local/randfold/src/randfold /usr/bin/randfold

執行如下測試命令。

randfold -d let7.tfa 999

當系統回顯類似如下信息是，表示randfold執行成功。

cel-let-7???????-42.90??0.001000

鯤鵬

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