鯤鵬服務器上源碼部署基因測序軟件kentUtils

kentUtils是與UCSC基因組瀏覽器結合使用的一系列生物信息學實用程序。

1?????? 安裝準備

華為云購買一臺鯤鵬服務器

本文以云服務器KC1實例搭建，云服務器配置如表1-1所示。

表1-1?云服務器配置

項目

說明

規格

kc1.large.2 | 2vCPUs | 4GB

磁盤

系統盤：高IO（40GB）

表1-2?CentOS操作系統要求

項目

說明

-

CentOS

7.6

在公共鏡像中已提供。

Kernel

4.14.0-115

在公共鏡像中已提供。

2?????? 配置編譯環境

安裝依賴。

yum?install?zlib-devel?openssl-devel?libpng-devel?mysql-devel?-y

3?????? 獲取源碼

cd?/usr/local/src wget?https://github.com/ENCODE-DCC/kentUtils/archive/v302.1.0.tar.gz?-O?kentUtils-302.1.0.tar.gz

4?????? 編譯和安裝

tar?-zxvf?kentUtils-302.1.0.tar.gz cd?kentUtils-302.1.0 make?-j4

5?????? 運行和驗證

查看工具集

cd?/usr/local/src/kentUtils-302.1.0/bin ls

鯤鵬 基因測序

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