RDKit | 基于R基團(tuán)分解(R-group decomposition)高亮分子

一組共享一個(gè)共同骨架的分子上做R基分解（RGD，R-group decomposition），為那些對(duì)準(zhǔn)骨架的分子生成坐標(biāo)，并生成分子圖像，其中的R基團(tuán)被涂上了顏色，使它們?nèi)菀妆惶暨x出來。

注：RDKit版本≥2020.09.1

導(dǎo)入庫

import rdkit

from rdkit import Chem

from rdkit.Chem import Draw

from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole

IPythonConsole.molSize=(450,350)

from rdkit.Chem import rdRGroupDecomposition

from rdkit.Chem import rdqueries

from rdkit.Chem import rdDepictor

from rdkit.Chem.Draw import rdMolDraw2D

from rdkit import Geometry

rdDepictor.SetPreferCoordGen(True)

import pandas as pd

from IPython.display import SVG,Image

from ipywidgets import interact

print(rdkit.__version__)

2020.09.1

版權(quán)聲明：本文內(nèi)容由網(wǎng)絡(luò)用戶投稿，版權(quán)歸原作者所有，本站不擁有其著作權(quán)，亦不承擔(dān)相應(yīng)法律責(zé)任。如果您發(fā)現(xiàn)本站中有涉嫌抄襲或描述失實(shí)的內(nèi)容，請(qǐng)聯(lián)系我們jiasou666@gmail.com 處理，核實(shí)后本網(wǎng)站將在24小時(shí)內(nèi)刪除侵權(quán)內(nèi)容。

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